Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SOBPA7XYQ1 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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SOBPA7XYQ1 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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