Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NPIPB13A6NJU9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NPIPB13A6NJU9 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms