Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSDA5PKW4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms