Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRG3Q9Y2Y8 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms