Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP20Q9Y2K6 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP20Q9Y2K6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms