Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms