Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PEMTQ9UBM1 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms