Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC180Q9P1Z9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms