Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GDE1Q9NZC3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms