Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms