Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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