Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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PFDN4Q9NQP4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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PFDN4Q9NQP4 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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PFDN4Q9NQP4 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN4Q9NQP4 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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