Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYP4F12Q9HCS2 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms