Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPN11-205ENST00000635625 1794 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHF6-203ENST00000370800 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP112-201ENST00000411213 318 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRIR-202ENST00000414795 506 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL031770.1-201ENST00000430842 851 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01304-203ENST00000453880 812 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091820.1-201ENST00000523497 648 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02455-201ENST00000541881 496 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR61-202ENST00000558311 1266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC124319.1-201ENST00000576808 653 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 GDPD1-205ENST00000581140 1265 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBXN8-207ENST00000615729 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL078582.1-201ENST00000641922 511 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009061.2-203ENST00000635000 1462 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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