Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIRIP3Q9BW71 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms