Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFHD1Q9BUP0 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms