Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MCMBPQ9BTE3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms