Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAAF1Q9BRP4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms