Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 ZFAND6-220ENST00000561060 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AL356488.3-201ENST00000608574 2888 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPOCK3Q9BQ16 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms