Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PHOX2BQ99453 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms