Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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