Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTP4Q96DX8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms