Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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RNF183Q96D59 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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RNF183Q96D59 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF183Q96D59 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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RNF183Q96D59 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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RNF183Q96D59 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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RNF183Q96D59 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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RNF183Q96D59 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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RNF183Q96D59 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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RNF183Q96D59 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF183Q96D59 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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