Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKD2Q969F2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms