Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 AC010894.2-201ENST00000444196 561 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
USP9XQ93008 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms