Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UBXN4Q92575 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms