Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
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