Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM35BQ8NCS4 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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