Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPAS3Q8IXF0 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms