Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CATSPER4Q7RTX7 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CATSPER4Q7RTX7 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms