Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TCF23Q7RTU1 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TCF23Q7RTU1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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