Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPPQ6IPU0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms