Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FAM46CQ5VWP2 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM46CQ5VWP2 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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