Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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LINC01545Q5VT33 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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