Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LGSNQ5TDP6 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LGSNQ5TDP6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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