Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KLHL12Q53G59 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms