Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms