Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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