Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PTPRNQ16849 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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