Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLPPQ16740 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms