Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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CDKN3Q16667 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDKN3Q16667 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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CDKN3Q16667 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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CDKN3Q16667 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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