Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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ECM1Q16610 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ECM1Q16610 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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