Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNAPC1Q16533 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SNAPC1Q16533 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SNAPC1Q16533 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SNAPC1Q16533 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SNAPC1Q16533 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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