Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK4Q16099 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIK4Q16099 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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