Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms