Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NPTX1Q15818 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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