Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRKQ15262 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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