Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL19A1Q14993 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms