Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms