Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
APOFQ13790 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
APOFQ13790 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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